Распределение гаплотипов кластера TLR1-TLR10 в популяции татар

Для расчета частот гаплотипов у татар Челябинской области использовались относительные частоты аллелей. В популяции татар встречаются все четыре возможных гаплотипа, но наиболее часто встречающиеся гаплотипы 1805*Т – 745*С и 1805*G – 745*A (hf=29,5%; hf=44,1% соответственно). Гаплотип 1805*G – 745*C (hf=15%) встречается значительно реже как и 1805*Т – 745*A (hf=11,4%), имея при этом близкие по значению частоты.

При этом можно сравнить полученные частоты с другими популяциями и получить вывод, что гаплотип 1805*G – 745*A встречается у татар ЧО и европейцев гораздо чаще, чем у азиатов. В то время как гаплотип 1805*Т – 745*С наоборот, гораздо чаще встречается у азиатов и татар ЧО, чем у европейцев. Гаплотип 1805*G – 745*C не встречается в ходе исследования у азиатов Пекина, но присутствует с малой частотой у других популяций, что может свидетельствовать о результате положительного отбора мутаций в ходе исторических событий, связанных с этой популяцией. Гаплотип 1805*Т – 745*A встречается чаще у азиатов, со средним значением количества у татар ЧО и практически не встречается среди европейцев. Все вышеперечисленные данные результаты можно увидеть на рисунке 10.

Рисунок 10. Сравнение распределения гаплотипов кластера TLR1-TLR10 в различных популяции

Гаплотипы с неравновесным сцеплением

При определении неравновесного сцепления гаплотипов были получены следующие результаты. Частоты гаплотипов 1805*Т – 745*A и 1805*Т – 745*С имеют высокое значение D’, что свидетельствует о сильном сцеплении при частоте в 41,1% у татар ЧО по 1805*Т – 745*A и 29,5% по 1805*Т – 745*С.

Гаплотип 1805*Т – 745*A встречается чаще у европейцев примерно в 3 раза, чем у азиатов, в то же время является сцепленным, так как имеет приближённую к 1 коэффициент неравновесного сцепления. Такое распределение гаплотипа среди европейцев и татар может свидетельствовать о положительном отборе в ходе истории этих народов. А именно, такая мутация имела положительный эффект для людей во время эпидемии чумы, так как влияла на ослабление восприимчивости организма к данной болезни. С другой стороны, можно рассмотреть частоту гаплотипа 1805*Т – 745*С, которая достаточно часто встречается у азиатов и в меньшем соотношении – у татар. Но гаплотип 1805*Т – 745*С встречается в среднем чаще, чем у европейцев, что позволяет сделать вывод, что татары исторически имели родство с азиатами.

Таблица 4. Распределение неравновесного сцепеления гаплотипов 3х популяций.

D' – коэффициент неравновесного сцепления. * p<0,01 ** p<0,001

ЗАКЛЮЧЕНИЕ.

В ходе данного исследования впервые была проведена оценка распределения генов и гаплотипов кластера TLR1 – TLR10 в популяции татар Челябинской области. В результате стало известно, что популяция татар по профилю кластера TLR1 – TLR10 имеет сходство с популяциями европейского и азиатского происхождения. Благодаря полученным данным, были обнаружены следы положительного естественного отбора в популяции татар Челябинской области, который действовал на территории Европы во время эпидемий чумы. В результате этого отбора у европейских популяций стал преобладающим гаплотип 1805*G – 745*T. В популяции татар Челябинской области данный гаплотип встречается немного реже, что связано с историей формирования татар, включавшей миграцию в Европу из Азии

Исследование генетического профиля популяций по генам TLR имеет особое значение для медицины и биологии. Изучение особенностей частот генетических полиморфизмов в генах системы TLR позволяет получить данные об инфекционной нагрузке, которой подвергалась популяция на протяжении всего периода своей истории, а также предопределить ответную реакцию представителей этой и других популяций на различные патогены, предрасположенность к аутоиммунным заболеваниям. Это исследование способствует оптимизации профилактических действий по иммунизации и позволяет найти новые, более эффективные пути терапии.

ВЫВОДЫ.

По частотам гаплотипов TLR1-TLR10 популяция татар Челябинской области в целом схожа с европейцами, но обладает более высокой частотой гаплотипа T-A, характерного для азиатов.