Таможенные органы составляют единую федеральную централизованную систему.

Таможенными органами являются:

1) федеральный орган исполнительной власти, уполномоченный в области таможенного дела;

2) региональные таможенные управления;

3) таможни;

4) таможенные посты.

Федеральная таможенная служба (ФТС России)[3] является федеральным органом исполнительной власти, осуществляющим в соответствии с законодательством Российской Федерации функции:

1. по выработке государственной политики и нормативно-правовому регулированию,

2. контролю и надзору в области таможенного дела,

3. функции агента валютного контроля,

4. функции по защите прав на объекты интеллектуальной собственности,

5. функции по проведению транспортного контроля в пунктах пропуска через государственную границу Российской Федерации,

6. функции по проведению санитарно-карантинного, карантинного фитосанитарного контроля и государственного ветеринарного надзора в части проведения проверки документов в специально оборудованных и предназначенных для этих целей пунктах пропуска через государственную границу Российской Федерации (специализированные пункты пропуска),

7. функции по выявлению, предупреждению и пресечению преступлений и административных правонарушений, отнесенных к компетенции таможенных органов Российской Федерации (далее - таможенные органы), а также иных связанных с ними преступлений и правонарушений.

Федеральная таможенная служба находится в ведении Министерства финансов Российской Федерации.

Федеральная таможенная служба осуществляет свою деятельность непосредственно, через территориальные органы Службы и свои представительства (представителей) в иностранных государствах во взаимодействии с другими федеральными органами исполнительной власти, органами исполнительной власти субъектов Российской Федерации и органами местного самоуправления, Центральным банком Российской Федерации, общественными объединениями и иными организациями.

ФТС России имеет в ведении научно-исследовательские учреждения, образовательные учреждения высшего профессионального и дополнительного образования, учреждения здравоохранения, печатные издания, информационно-вычислительные центры и другие учреждения, а также государственные унитарные предприятия, деятельность которых способствует решению задач, возложенных на таможенные органы.

Региональное таможенное управление (РТУ) [4]

Таможенные органы, непосредственно подчиненные Федеральной таможенной службе России