Последовательность сходства известных фаги генов устойчивости

ДНК-секвенирования в ПЦР-реакции, усиливаются Ген-фрагменты

более 97 до 100% - ное Совпадение с показало положили в базах данных за

Записи. Например, PCR-продукта, признаками abiM служит, 650 ВР

дня. Таким образом, 76,6% 849 ВР длинного кодирования закончатся выбранной последовательности. Которые

Последовательный анализ показывает воспроизводимые 16 замененные баз. Что соответствует 97,4% - ный

Идентичность на уровне ДНК. Сравнение аминокислотных последовательностей показывает, что 3 из

обменялись базами привести к молчащей мутации. 8 вызвать мутации

Обмен аминокислот с подобными функциональных групп, таких как валин против

Изолейцин. Остальные 5 мутаций приводят к гравировать их Изменения в

Аминокислотной последовательности. Будут ли эти изменения положительными или отрицательными на

Работоспособность фаги повлиять на устойчивость механизма, можно только экспериментально

будут уточнены.

При анализе исходной культуры Probat 8/0 и их брожений вступил в abiP -PCR

вместо 625 bp-фрагмент 830 bp длинная ПЦР-продукта. В Бременском Страна-Творог

эти два ПЦР были идентифицированы фрагменты в том же образце. Обе Банды

были вырезаны из геля и секвенированы. Это 625 bp-фрагмент показывает на ДНК

Уровне 96,2% идентичность Последовательности относительно опорной последовательности U90222 в базе данных (et Schouler

al., 1998a). Изменение нуклеотидной последовательности приводит к замене 7 аминокислот.

Что представляет собой процент от 3,6% (рис. 9). Созданный Primer несколько усиливаются

Итак, Ген abiP.

Последовательность анализа большого ПЦР-Фрагмента включает 828 оснований. Первые 138 баз

91,3%, последние 300 баз 95,7% идентичности Последовательности показывают по известным из литературы

Последовательности. Между ними 390 оснований длинный диапазон, никакого Сходства лежит в

Баз данных депонированных последовательностей имеет. С 147 между базами-это

Page 65

3. Результаты

_____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________

залуживали зонах см. раздел в Последовательности 625-bp-фрагмент значительно короче. Как

Рис. 9 показывает, остаются на уровне ДНК обнаруженной гомологии в области

Аминокислотной последовательности. Две области с высокой последовательности сходство мудрецов 17

договорная менял на аминокислоты, что соответствует 11,5%. Из 828 bp-фрагмент

полученный белок будет состоять из 325 аминокислот и будет на 33% больше, чем из

из литературы известен AbiP-белка.

Рис. 9. Сравнение аминокислотной последовательности из литературы известны фаги сопротивления

mechanismuses AbiP из Бременских страна-творог изолированных последовательностей.

Фаги резистентности в брожений с различной раздражающий

Из 3.2.1 вытекает, что стартовые культуры Probat 8/0 Ген сопротивления для защиты

Фаги адсорбции, 8 генов для ограничения на фаги ДНК и 8 генов созревания

и выпуск фаги предотвратить, содержит. При этих брожений стартовая культура

количество различных фаги генов резистентности в ходе скисанием был

по сравнению. Гены для адсорбции, устойчивости, рестрикционных ферментов Lld I, Lla 1403,

Lla II, Lla B I, Lla D I и Авива произошли во время брожений в значительной

Объемы на. Гены scr F, lla B II, lla C I, abiC, abiG1, abiG2, abiH, abiK, abiM и АБИН

играли на всех брожений второстепенную роль и были в максимум 5%

исследованные изоляты одного забора временени доказана.

Page 66

3. Результаты

_____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________

Объявления

Lld I

Lla1403

Lla II

LlaB I

LlaD

II

Авива

Брожения с

Нарушается окисление

Labtank

% d

Он u

Ntersu

Хотите

Изоляты

Фаги гены устойчивости

Стартовая культура

Probat 8/0

Брожения с

Непрерывное окисление

Кислота будильник

Labtank

После мрачной проявилась во время брожений с непрерывным pH-понижение

в сравнении с исходной культуры неизменное или повышенное количество

Фаги Генов Устойчивости (Рис. 10). Данное увеличение произошло в фаги свободной кислоты и будильник

фаги на загрязненных Labtank. При ферментации с неравномерным мрачной истории

гораздо меньше фаги гены устойчивости были при pH 4,7 присутствует в качестве стартовой культуры.

Рис. 10. Фаги гены резистентности после брожений с нормальным или нарушенным скисанием.

При нормальном säuernden брожения все фаги гены резистентности происходят в высших

Процентах на, чем при ферментации с замедленным скисанием. Сравнение с рис.

11 и рис. 12 показано, что адсорбция резистентности у двух брожений при рН

Значение 5,8 около 65% Lactococcus штаммов присутствовал. При хорошем

Ферментации на этот процент вырос в ходе дальнейшего окисление на 81%, в то время как он

при нарушении окисление ослабела. Аналогичная история была с lla II и у "Абортивной

Infection of Phages"-Gen Авива наблюдать, что при рН 5,8 в 66.

70% изолятов. После плохого скисанием еще только 38% состояли из

исследованных штаммов Ген, при равномерной скисанием % на комплект остался

его высокий уровень.

Page 67

3. Результаты

_____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________

Объявления

Lld I

Lla1403

Lla II

LlaB I

LlaD

II

Авива

%

Из untersu

ch

Ten изолятов

Фаги гены устойчивости

pH 5.8

pH 4.7

Объявления

Lld I

Lla1403

Lla II

LlaB I

LlaD

II

Авива

pH 5.8

pH 4.7

%

Обследованных

Изоляты

Фаги гены устойчивости

Рис. 11. Фаги генов резистентности в норме säuernden брожения в Labtank.

Рис. 12. Фаги генов резистентности в Labtank брожения с нарушением скисанием.

Page 68

3. Результаты

_____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________

Процент генов резистентности lld I, lla 1403 и lla B I лежал при постоянной

säuernden брожения минимум на 20% выше, чем при брожении с задержкой

Скисанием. Ген сопротивления lla D II был независимо от рН-журнал для всех

Брожений в 18-29% исследованных изолятов существует.